Najprawdopodobniej wpadłeś w nieskończoną pętlę lub twój skrypt wykonuje czasochłonną operację (np. analizuje logi 20 MB). Jeśli uważasz że trzydzieści sekund to dla ciebie zbyt mało zmień to za pomocą funkcji set_time_limit() lub w php.ini dyrektywą max_execution_time